典型应用领域介绍
广泛应用于:分子标记辅助育种、基因组学、系统生物学和分子进化、转基因研究等生物化学研究领域植物组织核酸提取。
分离完整种子中的核酸,需先用机械方法破碎种子,再提取和纯化核酸。通常的机械破碎方法速度很慢而且易导致交叉污染,不适合高通量的种子破碎。
用GENO 对微孔板中的种子进行研磨,可从种子细胞中快速释放出大量核酸;再从匀浆液中分离纯化出核酸。例如:用水浸泡过夜大豆,3 分钟内被均质化成浆液,用于DNA 分析的材料来源。
从培养细胞中快速提取基因组D N A为P C R 分析做准备
PCR 技术提高了核酸检测和定量测序效率。但在模板扩增前需要一个包括细胞收集和核酸溶解纯化的步骤,过程缓慢。然后用层析树脂把核酸从裂解液中分离出来。需要耗费大量时间和昂贵的材料。
GENO 技术快速破碎大量培养细胞,为后期基因组DNA 进行PCR 分析做准备。GENO 对微孔板中大量培养细胞,进行高通量均质化处理,再通过层析树脂对核酸进行纯化,从而进行PCR 分析,大大提高基因组分析的效率。
Yeast 酵母的9 6 孔高通量破碎
酵母已成为基因表达研究和蛋白质重组表达的通用宿主,成为生物系统研究模式型生物,成为生物药学家的有力工具。包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces 均被研究者所使用,如Saccbatomyces 酵母。酵母mRNA 和细胞内蛋白,很难用传统酶解方法提取。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它们不仅会攻击细胞壁,而且会攻击特定分子。并且,酶解产生的原生质体,需借助特定的试剂进行溶解,而导致很多蛋白质变性失活。
通常的压榨或球磨方式,只能在单样品下破碎酵母细胞,释放其内溶物,操作效率太低。GENO 专为那些需要大量酵母克隆进行高通量筛选检测的实验,设计了破碎种子的深孔板,在深孔板中对酵母进行破碎。实现高通量地分裂细胞。
细菌细胞的裂解(嗜盐菌和杆菌)Bacterial Cells
GENO 借助碰撞,裂解细菌细胞。以格兰氏阴性耐盐菌Halomonas elongate 和格兰氏阳性杆菌为模式的研究对象,SPEX 发展了两种相应技术:1)细菌培养,收获并冲洗掉多余的培养基,将细胞悬浮于深孔板的盐水溶液中,2)GENO 可借助研磨介质, 进行细胞振荡破碎,6-9 分钟就释放出足够量的核酸,进行后续试验。
QuEChERS 方法
Geno/Grinder 研磨仪可用于QuEChERS 方法中的样品处理步骤,可以用Geno研磨仪进行水果、蔬菜植物组织的均质化,从而更高效、快速的研磨处理样品,为后续的LC/MS/MS 方法测试残留农药做准备。可以在室温下均质化或者配合Kryo-Tech 冷冻装置使用,为了消除交叉污染需要添加QuEChERS 试剂。
目前,美国FDA 食品药品管理局和美国环保局EPA均采用Geno 研磨仪作为标准设备进行水果、蔬菜植物组织的均质化处理。
根据美国环保署U S E P A 和食品药物管理局U S F D A, L C / M S / MS 测试食品残留农药,样品处理采用不同方法之比较说明
采用GENO/Grinder 萃取器来增快残留农药, 霜脲氰(Cymoxanil),的LC/MS/MS 分析之样品处理,其产能达到一般方法三倍、杜邦方法两倍数量的样品,大大节省时间人力成本的耗费。回收率(SPIKERECOVERY) 和其他QA/QC 的效果一致。